不同的传染病，消毒的重点对象不一样，所采取的消毒措施也就有所不同。
对于呼吸道传染病，消毒的重点是室内空气和病人的呼吸道分泌物。对室内空气，应在加强通风换气的基础上，必要时采取喷洒化学消毒剂（过氧乙酸、过氧化氢或84消毒液等）、紫外线照射、安装空气消毒机等措施；对病人分泌物，可加入含氯消毒剂（84消毒液、漂白粉上清液等），搅拌均匀，消毒后倒入厕所。
对于消化道传染病，消毒的重点应是病人的餐饮具、排泄物、剩余食物。可采取开水煮沸或蒸煮的方式进行消毒。排泄物、剩余饭菜也可按上述病人分泌物的处理方式进行消毒。
对于直接接触性传染病，消毒的重点应是病人使用的有关物品。可采取煮沸、消毒剂擦拭或浸泡等方式进行消毒。
对于经血传播的传染病，消毒的重点应是病人血迹污染物，可采取消毒剂浸泡、擦拭等方式进行消毒。
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需要注意的是，并不是所有的传染病都必须进行消毒处理，一般情况下，只在传染病病原体抵抗力较强、可能对他人构成传染威胁的情况下，才需要采取相应的消毒措施。
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